I’m very happy to start a collaboration with Jean-Frédéric Terral and to be affiliated to the UMR CBAE now. I’ll work on my ongoing projects, and particularly Momocs and other morphometrics stuff and hopefully start new ones soon.
Made with love by Ricardo Kriebel : http://biologyr.com/
Où j’y tchatche avec Arthur de Plume!, qui va bientôt pondre un projet éditorial libre et rebelle, aux petits oignons. C’est par là.
Merci à Terra One et à Radio Campus Montpellier pour l’invitation.
Vincent Bonhomme, Prasad S., Cédric Gaucherel
Pollen grains have long fascinated biologists who used their remarkable interspecific diversity as a marker to infer profiles of past and present vegetations and environment. This study addresses the question of the diversity of the morphology of pollen grains at the intraspecific level: how different are pollen grains of the same species sampled in different populations? Such differences are expected, and are actually well known to palynologists, but at the same time technically challenging to quantify. We used Elliptic Fourier Analysis, a powerful morphometric approach for the comparison of outlines, on equatorial and polar views of 30 pollen grains sampled in two different populations for each of five tropical species, thus yielding 600 outlines. Multivariate analysis of variance revealed intraspecific variation of shape of the pollen grains in three out of the five species studied. Our goal here was to test if there were differences in the shape of pollen. This, to our knowledge, would be the first such study of this particular aspect of palynology. We also discuss some relevant evolutionary hypotheses. Further studies using outline analysis, coupled with a choice of appropriate sampling strategies, to suit varying environmental conditions, would prove of great value in testing such hypotheses.
Keywords: modern morphometrics, outline analysis, anemophilous pollen.
To be published in: Plant Systematics and Evolution
Vincent Bonhomme, Romain Frelat, Cédric Gaucherel
The shape of watersheds is linked to its geomorphological origin and its hydrological behavior. The present study uses elliptical Fourier analysis to describe shapes of watershed outlines. With two successive analyses, considering or not the outlet position, on a case study in Haiti, we identify on these shapes more than the classical shape descriptors such as elongation, asymmetry, regularity and curvature. This method completes traditional analysis of shape on watersheds and may ultimately help to identify a link between the shape and the behavior of watersheds.
Keywords: watershed, modern morphometrics, elliptical Fourier analysis, Haiti.
To be published in: Géomorphologie : relief, processus, environnement. Special Issue: Quantitative geomorphology.
A l’occasion de la semaine de l’écologie, Plume! a posé un pied dans le sud de l’Inde et j’ai eu le plaisir de collaborer au montage d’un cycle de conférences, de projections et d’expositions à Pondichéry.
Nous y avons parlé, d’écologie, d’évolution, d’écologisme. Je mets à disposition le diaporama utilisé ce jour là. Les illustrations sont de l’excellent François Dolambi. Le but est de parler d’évolution en environ une heure et ça s’appelle Une tartine d’évolution.
Je le place sous licence libre Creative Commons by-nc,ce qui signifie que vous pouvez l’utiliser à des fins pédagogiques, l’améliorer et aussi prendre le temps de me faire remonter vos remarques et vos ajouts constructifs!
Last day, playing with elliptic Fourier functions, I have found these things below. Technically, this is done by sampling the same number of points (i.e. 300) on the inverse Fourier Elliptical Transforms outlines defined by adding one more harmonic (π; -π; π; π) at every step. Color is just here to show the successive steps. Useless but funny. And you have the right to not find this funny.
Question posée, début septembre 2011 à trois classes de seconde du lycée français de Pondichéry, dans le sud de l’Inde.
J’aime bien commencer par un petit brainstorming et que chacun des élèves envoie un mot, une représentation. Non seulement ça brise la glace, mais en plus à terme on pourrait faire des stats, certes gentilles, dessus. Je mets la photographie du tableau obtenu avec ces classes et suivant quelques règles simples : 1) poser et répéter la même question précise, ici : “qu’est-ce que le métier de chercheur en biologie vous évoque?”, 2) repréciser les mots trop vagues et trop synonymes et, naturellement, 3) pas de censure.
Trois contrastes avec mes quelques expériences françaises m’ont marqué lors de cette sympathique et première session tropicale d’ouverture-des-portes-du-labo :
Alors qu’est-ce que ces têtes pas toutes blondes ont de différent d’avec les gamins de métropole ? Il est certain qu’ils appartiennent à des classes sociales plus hautes, en moyenne, à celles d’avec qui j’établis le parallèle, mais cela ne me convainc pas.
D’autres sessions permettraient d’y voir plus clair, notamment avec les collègues physiciens, matheux et informaticiens. Peut-être arrivera-t-on à trancher entre simple coïncidence ou condition sociale. A moins que les Tropiques aient aussi quelque à voir là-dedans, notamment sur le point 3 ?
A propos de Tropiques et de leurs influences, lire La Condition Tropicale de l’ami Francis Hallé, aux non moins excellentes éditions Actes Sud.
Qu'est-ce que pour vous le métier de biologiste ?
